Kebanyakan penerbangan dari Xiamen Gaoqi International Airport adalah ke Macau dan ke Beijing tetapi terdapat banyak lagi penerbangan ke destinasi lain juga, kebanyakannya melalui XiamenAir. Berikut ialah destinasi paling popular dari Xiamen Gaoqi International Airport:
Macau (MFM)
Beijing (BJSA)
Manila (MNL)
Bangkok (BKKA)
Jakarta (JKTA)
Kuala Lumpur (XKLA)
Hong Kong (HKG)
Seoul (SELA)
Amsterdam (AMS)Denpasar Bali (DPS)
Sydney (SYD)Melbourne (MELA)
