Kebanyakan penerbangan dari San Jose del Cabo Los Cabos International Airport adalah ke Buenos Aires dan ke Baltimore tetapi terdapat banyak lagi penerbangan ke destinasi lain juga, kebanyakannya melalui . Berikut ialah destinasi paling popular dari San Jose del Cabo Los Cabos International Airport:
Buenos Aires (EZE)
Baltimore (BWI)Denver (DEN)
Denpasar Bali (DPS)
Bangkok (BKKA)
Amsterdam (AMS)
Auckland (AKL)
Delhi (DEL)
Brussel (BRUA)
Guadalajara (GDL)
Hong Kong (HKG)
Paris (PARA)
Dublin (DUB)
Brisbane (BNE)
