Penerbangan Manokwari dilayani oleh Airport Rendani (MKW). Manokwari dapat diakses langsung oleh pesawat dari beberapa kota besar di Indonesia seperti Jakarta, Surabaya, Makassar, Manado dan Jayapura.
Rendani Airport bukan bandara besar jadi tidak banyak penerbangan berangkat dari bandara ini. Hanya beberapa tujuan dapat anda capai dari Rendani Airport, kebanyakan dioperasikan oleh Super Air Jet. Orang sering terbang ke Makassar dulu dan transfer ke penerbangan lain di bandara itu.
Bandara Rendani memiliki satu landasan pacu dan terminal modern yang baru (2013).
Bandara Rendani berada di dalam kota, di Jl. Trikora Rendani, hanya 5 kilometer barat daya pusat.
Dari bandara ada beberapa transportasi umum (angkot: Rp. 4.000) menuju Terminal Wosi.
Di luar bandara juga ada ojek dengan tarif Rp. 15.000 ke kota.
Anda bisa menggunakan taksi ke kota diluar bandara dengan tarif Rp. 50.000.
