Penerbangan Manokwari dilayani oleh Airport Rendani (MKW). Manokwari dapat diakses langsung oleh pesawat dari beberapa kota besar di Indonesia seperti Jakarta, Surabaya, Makassar, Manado dan Jayapura.
Kebanyakan penerbangan dari Rendani Airport adalah ke Sorong dan Makassar tapi adalah penerbangan ke tujuan lain juga, kebanyakan dioperasikan oleh Lion Air. Ini tujuan terpopular dari Rendani Airport:
Sorong (SOQ)Makassar (UPG)Jakarta (JKTA)Jayapura (DJJ)Nabire (NBX)Bandara Rendani memiliki satu landasan pacu dan terminal modern yang baru (2013).
Bandara Rendani berada di dalam kota, di Jl. Trikora Rendani, hanya 5 kilometer barat daya pusat.
Dari bandara ada beberapa transportasi umum (angkot: Rp. 4.000) menuju Terminal Wosi.
Di luar bandara juga ada ojek dengan tarif Rp. 15.000 ke kota.
Anda bisa menggunakan taksi ke kota diluar bandara dengan tarif Rp. 50.000.
