Wamena Airport bukan lapangan terbang yang besar jadi tidak banyak penerbangan yang berlepas ke sini. Hanya terdapat beberapa destinasi yang boleh anda capai dari Wamena Airport, kebanyakan destinasi ini dikendalikan oleh . Ramai orang mengambil penerbangan ke Jayapura dan berpindah ke penerbangan lain di sana.
Jayapura (DJJ)