De meeste vluchten van Eindhoven Airport zijn naar Alicante en Lissabon maar er zijn veel meer direct vluchten naar andere bestemmingen, de meeste door Ryanair. Dit zijn de meest populaire bestemmingen vanaf Eindhoven Airport:
Alicante (ALC)
Lissabon (LIS)
Amsterdam (AMS)
Londen (LONA)
Iasi (IAS)
Wenen (VIE)Barcelona (BCN)Manchester (MAN)
Budapest (BUD)
Katowice (KTW)Ibiza (IBZ)
